В селе Варфоломеевка школа начала действовать в тридцатые годы. Это была четырехлетняя школа.
В 1960-е годы была построена новая восьмилетняя школа (нынешний интернат). Школу строили всем селом, после рабочего дня: выкладывали саман, подвозили его на место, возводили стены.
В 1970-е годы, благодаря инициативе Л.И. Федчуновой, был разбит пришкольный участок, на котором росли и овощи, и плодовые деревья.
31 августа 1978 года торжественно раскрыла свои двери для варфоломеевксих школьников новая школа.
В школе существуют свои традиции: проводятся День самоуправления, принятие в старшеклассники, «Зарница». В школе действует комната краеведения, которая собирает и бережно хранит историю села.